NetBSD/amiga はデフォルトは gcc 2.95。gcc 3.3.1 でコンパイルするためには、 /etc/mk.conf に HAVE_GCC3=yes が必要。また、いくつか warning が出るので、パッチを当てる必要がある。あと、/usr/include/m68k/stdarg.h とかの書き換えもいる。X で Type1 と TrueType フォントを使わないようにしたら、 X が落ちる事が無くなりました。
Type1 と TrueType は別マシンで、xfs を使っています。